Báo cáo khoa học: Cấu trúc tinh thể tia X của Laminarinase 16A từ Phanerochaete chrysosporium phức hợp với các sản phẩm thủy phân từ lichenin và laminarin
Ngành:
Sinh hóa học, Cấu trúc protein
Tóm tắt nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này công bố cấu trúc tinh thể tia X của enzyme Laminarinase 16A (Lam16A) thuộc loài nấm Phanerochaete chrysosporium khi tương tác với các sản phẩm thủy phân từ lichenin và laminarin. Với độ phân giải cao lần lượt là 1.1 Å và 1.6 Å, các cấu trúc tinh thể chi tiết đã hé lộ cơ chế enzyme liên kết với các phân tử glucan, đặc biệt là sự điều chỉnh vị trí liên kết để dung nạp các nhánh β-1,6. Nghiên cứu cũng làm sáng tỏ vai trò của các phân tử nước được bảo tồn và các tương tác protein-ligand trong việc ổn định trạng thái chuyển tiếp và cơ chế xúc tác thủy phân. Các cấu trúc được xác định trong nghiên cứu này là những cấu trúc tinh thể tia X đầu tiên của bất kỳ enzyme 1,3(4)-β-D-glucanase nào liên kết với các sản phẩm glucan, cung cấp những hiểu biết quan trọng về cơ chế xúc tác và tính đặc hiệu của enzyme.
Mục lục chi tiết:
- X-ray crystal structures of Phanerochaete chrysosporium Laminarinase 16A in complex with products from lichenin and laminarin hydrolysis
- Keywords
- Correspondence
- Note
- Introduction
- Abbreviations
- Results
- Overall structure
- P3 structure
- P4 structure
- Superposition of structures
- Substrate models
- Discussion
- The ẞ-1,6 branch
- Summary
- Experimental procedures
- Protein and ligand preparation
- Crystallization
- P3 co-crystallization
- P4 crystallization by soaking
- Structure determination
- Substrate models
- Superposition of structures and detection of conserved waters
- References
- Acknowledgements